什么是商业特许经营：
商业特许经营，是指拥有注册商标、企业标志、专利、专有技术等经营资源的企业(以下称特许人)，以合同形式将其拥有的经营资源许可其他经营者(以下称被特许人)使用，被特许人按照合同约定在统一的经营模式下开展经营，并向特许人支付特许经营费用的经营活动。
企业以外的其他单位和个人不得作为特许人从事特许经营活动。
只要通过以上方式进行招商合作的都需要备案。
为什么要在商务部办理商业特许经营许可备案：：
1、政策使然：国家为了规范加盟行业，在07年颁布了有关加盟的《商业特许经营管理条例》等系列法规。国家规定，所有从事加盟的企业都必须在商务部备案取得特许经营资格后才能从事特许加盟的经营活动，否则，企业的加盟经营活动是违法的，这也是鉴别一家从事加盟经营活动的企业是否合法可靠的重要标准。
《商业特许经营管理条例》第二十五条特许人未依照本条例第八条的规定向商务主管部门备案的，由商务主管部门责令限期备案，处1万元以上5万元以下的罚款;逾期仍不备案的，处5万元以上10万元以下的罚款，并予以公告。
《商业特许经营管理条例》第八条 特许人应当自首次订立特许经营合同之日起15日内，依照本条例的规定向商务主管部门备案。在省、自治区、直辖市范围内从事特许经营活动的，应当向所在地省、自治区、直辖市人民政府商务主管部门备案;跨省、自治区、直辖市范围从事特许经营活动的，应当向国务院商务主管部门备案。
2、招商加盟：加盟连锁经营模式在国内得到了迅猛发展，然而，加盟项目诈骗的新闻屡见报端，骗人招数繁多，令人防不胜防。所以现在考察一个项目的靠不靠谱，就从三个方面考察：第一、看有没有注册商标、企业标志、专利、专有技术等经营资源。第二、有无商务部的备案。第三、查公司所在地的工商信息。
商业特许经营许可备案是体现出一个连锁加盟企业是否正规合法经营及拥有成熟的经营模式的重要条件。
3、企业自身的权益保护：
在商务部进行了商业特许经营备案后，就只有备案企业有权对外从事特许经营活动，更大程度的加强了对公司知识产权以及经营模式、特许经营体系的保护。也使得企业对加盟商的约束和管理有更加可靠地法律依据。
商业特许经营备案属于行政备案而非行政许可
关于备案和许可的区别，按通俗的理解则为：备案是有备而来，有案可查；许可则是非经许可不得为之，令行禁止。这里需要对备案做进一步直观的解释，按照《商业特许经营管理条例》（下称“特许条例”）第八条的规定“特许人应当自首次订立特许经营合同之日起15日内，依照本条例的规定向商务主管部门备案。”只有首份特许经营合同的订立方可视为特许备案的充分条件，亦即启动程序。
依据《行政许可法》的规定，行政许可是指行政机关根据公民、法人或者其他组织的申请，经依法审查，准予其行为。但关于行政备案的法律定义却一直未能明确形成，这里采用学术研究将其界定为：行政机关依法要求公民、法人或其他组织报送行政管理相关材料，并存档备查的外部行政行为。《商业特许经营备案管理办法》（下称“备案办法”）第十五条规定了公众可通过商业特许经营信息管理系统查询到的信息范围，与备案办法第六条规定的申请备案的特许人应当向备案机关提交的材料范围进行比较，除去涉及企业商业秘密和个人隐私的材料外，公众可查询到的信息范围与企业提交的材料范围基本一致。
公众有一个误解认为只要规定了行政处罚的行政备案就应该归于行政许可或者等同于行政许可的效力。这里需要指出的是行政备案规定的行政处罚仅是对未按规定进行备案的行为而做出处罚，而不是就行政相对人的具体行为即市场经济活动做出处罚。特许条例以及备案办法中关于处罚的规定针对于特许人不备案、不如实备案以及其他违反行政管理的情形。