跨境电子商务服务业的第二个大类是物流快递服务。在跨境电子商务的带动下，近年来我国跨境包裹数量持续快速增长。联邦快递(FedEx)、联合包裹(UPS)、敦豪速递(DHL)、天地快运(TNT)、德迅(KN)等国际物流快递公司是跨境包裹的主要承运商。除快递公司外，还有马士基、中远、中海等海运公司可供选择。中国邮政、顺丰速运、中外运、韵达快递、中通快递等国内企业积极拓展跨境物流快递业务，取得了一定的突破。
中国邮政积极开展跨境物流快递业务，为中国电商卖家量身定制了轻小件物品国际空邮产品——国际e邮宝。国际e邮宝经济实惠，免收挂号费并为客户提供包裹跟踪信息查询服务，在正常情况下7-10个工作日即可完成妥投。截至2015年7月底，国际e邮宝已经开通了美国、俄罗斯、澳大利亚、巴西等十条空邮产品路线。
自2014年开始，顺丰速运加速全球化布局，为电商卖家提供跨境物流服务。面向有直邮需求的出口卖家，顺丰依托目的国的网络资源和清关系统推出国际小包服务，如美国小包、欧洲小包、澳洲小包、俄罗斯小包等，基本采取“航班直飞＋本土化派送”的方式，帮助卖家货通全球。顺丰在业内率先做出“先行赔付”的承诺，如果发生货件遗失，顺丰承诺在8个工作日内完成赔付。面向销售高价值商品、对物流时效要求更高的客户，顺丰提供专递服务。在进口方面，顺丰推出包括直邮、保税两种模式的“全球顺服务”。2015年7月，顺丰开通了首条跨境全货机航线。此外，顺丰计划建立20个全球仓，覆盖4个主要目标市场。2015年上半年，顺丰东欧仓已经启用，向中国国内发往俄罗斯及东欧、北欧的跨境电商卖家开放仓配一体化服务。
目前，中国邮政、顺丰速运等国内企业在国际覆盖范围、物流配送效率、物流信息采集等方面与国际物流快递公司相比还存在较大差距。物流快递仍是我国发展跨境电子商务面对的主要瓶颈。今后要鼓励和支持国内物流快递企业的国际化发展，拓展国内物流快递企业的国际服务网络，提高物流配送效率，力求为客户量身打造仓配一体的一站式物流供应链服务。同时，可制定跨境物流配送企业服务质量标准，促进跨境物流配送企业提质增效。
跨境电子商务服务业的第三个大类是支付服务。目前，在跨境电子商务领域，银行转账、信用卡，第三方支付等多种支付方式并存。跨境电子商务B2B目前主要以传统线下模式完成交易，支付方式主要是信用证、银行转账如西联汇款。跨境电子商务B2C主要使用线上支付方式完成交易，第三方支付工具得到了广泛应用。
在除中国之外的全球市场，美国的第三方支付系统PayPal(贝宝)是规模大的在线支付工具。2014年，PayPal总共处理资金2350亿美元，实现营业收入80多亿美元。PayPal支持100多种货币支付，覆盖全球203个国家和地区，拥有超过1.69亿的活跃客户。作为美国公司，PayPal无法在中国大陆开展本地支付，但为我国跨境电商提供外币在线支付服务已有多年。随着中国跨境电商的崛起，PayPal与越来越多的国内跨境电商平台开展合作，并携手银联打通国内银行卡(包括借记卡)，还将为中国商户正式推出B2B2C跨境电商解决方案。
我国一批的第三方支付本土企业，比如支付宝、财付通和银联电子支付，已获得跨境电子商务外汇支付业务试点资格、跨境人民币支付业务试点资格、跨境汇款业务试点资格等跨境支付业务试点资格，陆续进军跨境支付领域，致力于提供高效、便捷、安全的跨境网络支付服务。它们可以通过银行为小额电子商务交易双方提供跨境互联网支付(包括单笔交易不超过5万美元的货物贸易和留学教育、航空机票、酒店住宿等服务贸易)所涉及的外汇资金集中收付及相关结售汇服务。总体而言，第三方支付本土企业尽管发展很快，但目前尚不具备国际竞争力。今后要继续推进金融创新，在风险可控的前提下进一步扩大支付限额，引导和支持国内金融机构特别是支付企业“走出去”，逐步完善跨境电子支付体系，有效满足境内外企业及个人跨境电子支付的合理需求，助推跨境电子商务发展。（