一般情况下，公司在进入注销清算程序前，尤其是在清税前，应需要提前做好现金、存货等资产的处理，比如员工工资的支付、税款的清缴、社保和公积金的清缴、以及各种应付款项的支付，当然也包括对股东投资款的返款等。这样才能避免公司清算结束公司账面还有资金的情况发生。
公司注销的清算顺序是先清税，由当地的税务机关核查公司的完税情况，公司是否存在应交未交的各类税款，尤其是对存货的稽查，并确认公司是否存在应补缴的税款；公司拿到当地税务机关出具的清税证明后，可以到开户银行办理基本账户和其他结算账户的销户手续，公司在销户之前，需要将公司账面上的资金按照支付清算资金的先后顺序，将员工工资、税款和应付款项等逐笔支付出去，如果清算过后，公司账户上还有存款，则可以按照股东的持股比例转给各位股东。