用了6个月的时间，何刚带领IT部门完成了所有系统和软件的一一替换。“替代供应商产品，是为了从根本上解决三个关键痛点。首先，基于供应商的系统，很不稳定，比如小程序动不动就会出故障。其次你有任何需求，供应商的反应是很慢的，它会按照月为单位给你慢慢推进。第三就是严重的数据孤岛问题。”何刚认为，在数据孤岛问题上，存在一种“伪打通”：有时候供应商的系统、软件可以在运行上“勉强打通”，但真正要传输数据时，很容易出现丢字段、丢数据的情况，无法真正把多端数据拉到同一个BI系统里面做深层分析。
在完成系统替换后，何刚开启了第二阶段的转型。“这时候我们真正进入了深水区，其实直到，奈雪的数字化转型都还在这个深水区阶段。”
何刚将之描述为：首先实现数字化覆盖，覆盖所有业务——包括门店管理、供应链管理、开店选址、设计工程、公司OA。
何刚把奈雪的数字化体系分为三大板块：
块是面向终端客户的小程序、APP。这一部分是用户“肉眼可见”的系统，在奈雪内部这部分统一称作“交易营销”。
第二块是奈雪门店端的管理体系。门店端管理又分为管人、管机、管物。在管理人这一侧，数字化体系覆盖了包括招聘、培训、上岗、考勤等等环节。而在管理机器这一侧，包含POS机、收银机、显示屏等等，以及各个端口的数据联动。管物环节中，很重要一块是订货，由于奈雪门店有几百种SKU，所以需要解决复杂的货品管理问题，而数字化体系还需要覆盖日盘、周盘、月盘。而在整个过程中，为关键是如何通过数字化手段去优化成本和提高效率。
第三块则是奈雪的供应链管理。这部分包含了采购、物流、成本控制。以及，要通过数字化手段去解决复杂繁琐的食品有效期、食品安全问题。
在完成覆盖后，要进行自动化和智能化。自动化是要解决手工操作的问题，通过设备、系统，降低对人的依赖，并通过机器提高效率；而智能化要把很多需要人工预测、人工猜测、人工推测的环节通过数据系统升级为更智能的数据预测。
当时，奈雪门店的自动化和智能化程度较低：门店一般只有一个简单的门店货物管理系统以及一台POS机、一个叫号的小手机、几个演示的电子屏。在供应链端，当时奈雪还在采用金蝶财务软件来支撑采购等工作。