海运方面也面临无法应对突然增加的运输需求，订舱难度增大，跨境电商企业基本都需要提前订舱，甚至有些热门航线的排期从 1 周到1 个月不等。尾程派送主要面临因管控导致的人手不足、交通管制等问题。另外由于的影响，各国都加强了检疫检验流程。为了防止蔓延，在出入境口岸对进出境货物进行严格控制，商品检疫检验环节加强，货物清关时间延长，再加上防疫消毒，增加了在途时间，使得物流时效受到影响。
.从而可以减少单个卖家的人力和财力需求，努力联合企业进行本土化建设 。②智慧物流。借助物联网、云计算、大数据等新兴技术，加快研发智慧物流**技术，从而搭建“”沿线跨境快递包裹**追踪体系，实现可视化监控网络，争取将运输风险降到较低，确保商品运输过程安全问题 。
融合后运营缺乏同步性跨境电商企业想要提升对消费者的服务质量，需要跨境物流企业进行同步的配合。但在实际的经营中，跨境电商只考虑自己的服务是否能够给消费者提供好的购物体验，而从没考虑过物流方面的配合工作是否有难度。而物流方面在运输工作中，只考虑了物流的可投放性、人员配置和运输成本等问题，对电商配送要求置之不理。
2019 年期间，国家专门就跨境电商展开了探讨。提出，将改革完善跨境电商等新业态扶持政策，推动服务贸易业的发展。还表明，要优化进口结构，积极扩大出口；增设上海自贸试验区新片区，支持国家经济开发区、高新区、自贸试验区相关改革试点，打造新高地等为跨境电商业的发展提供强有力的政策支持和保障。