无菌袋的生产首先要在净化空间内生产制作，在选料、吹膜、制袋、包装、抽真空都要严格要求，以防对无菌袋的污染，在加工环节完成后，此时的无菌袋并不能达到完全无菌的状态，只能做到细菌数cfu/100cm²≤1000，想要达到无菌状态，必须做专业的灭辐照灭菌，辐照灭菌可以完全灭活百分之百的细菌芽孢，破坏微生物的细胞核，从而达到杀死细菌的效果。辐照灭菌的方式也有所不同，主要有钴60辐照灭菌和电子束辐射灭菌，钴60是靠放射性物质钴作为基础来灭活细菌，电子加速器是靠高能激光加速器给辐照灭菌。钴60辐照灭菌它使用一定剂量的波长极短的电离射线对无菌袋进行消毒。电子束辐射灭菌它是靠电子加速器产生的高能电子会造成生物细胞核的破坏来对无菌袋进行消毒的。 两种方式各有优缺点，钴60更为可靠稳定，但是缺点灭菌是时间长，相对时间成本更高，所以价格也会更高一些，就无菌袋这个产品而言在高剂量下灭菌，会使无菌袋产生一些泛黄的现象。电子束辐射灭菌在对一些低密度产品灭菌时会受到一定限制，但是电子束辐射灭菌可以在短时间内完成， 缩短了灭菌时间，使得无菌袋在生产时效上缩短交货时间，并且电子束在高剂量灭菌时不会对无菌袋外观产生颜色的改变。