海南注册公司的三大税收优惠政策主要包括：
企业所得税的减免政策：对注册在海南自由贸易港并实质性运营的鼓励类产业企业，减按15%征收企业所得税。
个人所得税的减免政策：对一个纳税年度内在海南自由贸易港累计居住满183天的个人，其取得来源于海南自由贸易港范围内的综合所得和经营所得，按照3%、10%、15%三档超额累进税率征收个人所得税。
零关税政策：对在全岛封关运作前，由企业提出申请且符合相关条件的四类物品，免征进口关税、进口环节增值税和消费税。
此外，海南还针对不同行业和领域的企业有不同的税收优惠政策。因此，在具体享受税收优惠政策时，需要根据自身企业的情况进行综合分析和判断。