好记云财税管理系统的一般结构是从系统的功能层次结构来反映的，所谓功能结构，是指系统按其功能分层分块的结构形式，即模块化的结构。系统可以划分为若干个子系统，每个子系统可划分为几个功能模块，每个功能模块再划分为若干个层次，每个层次沿横向分为若干个模块，每个模块都有相对独立的功能。
好记云分财税管理系统分为客户管理、财税服务及基础设置三大系统，以及与之相匹配的业务管理系统，真正实现“业、财、税”一体化。系统目前以财税服务为核心，分别提供票据、凭证、出纳、结账、工资、账簿、报表、资产、库存、报税等功能模块。具体功能模块设计与介绍如下：
1、票据
企业无需手工录入发票内容及明细，可将不同种类的发票进行一键导入、快速生成会计凭证，其中包括四类发票：进项发票、销项发票、费用发票、银行流水，并在票据分类模板，进行快速查询、查看、编辑等相关操作。
功能模块包括：进项发票、销项发票、进项（费用）发票、票据分类模板。
2、凭证
基于输入凭证进行记账，历史凭证的查询、修改、断号整理、打印，凭证模板的设置，所有凭证汇总及生成对应的表，通过严密的制单控制保证填制凭证的正确性。提供资金赤字控制、支票按制、预算控制、外币折算误差控制以及查看余额等功能，加强对发生业务的及时管理和控制，完成凭证的录入、审核、记账、查询、打印以及出纳签字、常用凭证定义等。
功能模块包括：录凭证、查凭证、凭证模板、凭证汇总表、凭证回收站。
3、出纳
出纳是财务中十分重要的角色，担负着现金、银行存款的收、付，传统的会计软件一般是以记帐凭证的输入开始。通过收入管理、支出管理、出纳帐处理，加强出纳人员对现金及银行存款的管理。此功能可完成银行日记账、现金日记账，随时出资金日报表、余额调节表以及进行银行对账。
功能模块包括：日记账、出纳对账、资金报表、账户与期初、收支类型。
4、结账
为避免出现已结账务出现的错误，另基于系统的灵活性，提供结账与反结账的管理，将原本已经结账完毕的账务重新恢复到结账前的状态，这个一般情况下会出现在本月结账时，发现本月会计账务处理有问题、有错误，即可通过反结账将已结账恢复到未结账之前的状态下，再将错误的会计分录修改正确后重新结账。
功能模块包括：结账、反结账。
5、工资
工资核算用来进行工资的发放和核算，一般包括：工资的编辑、计算、工资的发放、工资的分摊等。主要以计提发放职工个人工资的原始数据为基础，计算职工工资，处理工资核算。主要包括：设计工资项目及项目计算公式，录入职工工资基础资料，增减变动及修改，计算汇总，查询、打印输出等功能。
功能模块包括：员工档案、工资表。
6、账簿
账簿是方便企业对其经营项目的总体情况在财务方面的总结与体现。自动生成各种财务账目报表，如总账、科目明细账、多栏账、固定资产账等，用户可根据需求进入各类账簿，进行预览、查询、打印、下载，实现数据导出。强大的查询功能使整个系统实现总账、明细账、凭证联查，并可查询包含未记账凭证的新数据。
功能模块包括：科目余额表、总账、明细账、凭证序时簿、多栏账、辅助核算余额表、辅助核算明细账。
7、报表
企业会计核算的结果*后需要用报表的形式反映出来，因此、报表处理主要用于实现各种报表的制定、查询、修改、存储等功能，同时能够根据财务信息自动生多种形式的财务报表，支持资产负债表、利润表、损益表、库存月报表，自定义报表等等不同内容的报表。报表管理与总账管理相辅相成，总账提供财务数据生成财务报表。月末，完成凭证记账、损益类结转的月末处理后，进入报表管理，打开报表表格，进行数据关键字录入，系统经过数据计算整理完毕即生成对应财务报表。
功能模块包括：老板报表、财务管理报表、资产负债表、利润表、利润表季报、现金流量表。
8、资产
固定资产管理进行固定资产净值、累计折旧等数据的核算与管理，反映固定资产增减、原值变化、使用部门变化等。系统启用前，对资产类别、增减方式、使用状况、折旧方法等进行初始设置。购置固定资产时，以每一项资产名称录入固定资产卡片，详细录入其类别、名称、型号、原值、使用部门、折旧年限等信息，此步骤作用非常重要，它是此模块的数据来源和基础，录入的原始卡片应准确无误。此模块具有自动计提折旧的功能，生成折旧分配凭证，可通过记账凭证的形式传输到总账系统。
功能模块包括：资产卡片、资产折旧（摊销）、折旧（摊销）明细表、折旧（摊销）汇总表
9、库存
库存管理适应于对库存商品、原材料等进行供销存核算与管理。许多企业如商品零售业、制造业存货的数量与品种繁多，对存货实行严谨科学的管理是财务部门和仓库部门的重要工作目标，一方面对实物进行分类管理，另一方面建立完整的供销存管理体系，从账面上进行核算、控制、监督，为实现账实相符提供可信的依据。系统可根据凭证数据，自动生成出入库单，同时提供了“数量式库存报表”，也可在“辅助核算明细账”查询“存货辅助余额表”、“存货辅助明细账”，具有强大的计算、查询等功能，提供完整信息。
功能模块包括：入库单、出库单、库存月报表、库存台账。
10、报税
（1）智能准确出具国税纳税申报表：包括增值税、企业所得税、印花税、附加税等纳税申报表。
（2）智能准确出具国税财务申报表：包括资产负债表、利润表、现金流量表。
（3）智能出表并检核申报内容：智能出表，自动检测纳税申报表问题，给出调整建议。
（4）取数规则多样：申报表取数规则支持个性化定制，满足不同企业、行业个性化需要。
（5）企业所得税汇算清缴：提供企业所得税汇算清缴共 12 张申报表（1 主11 附），满足申报全资料自动填报。
（6）一键报税：为需要做纳税申报的用户提供方便、快捷生成申报表、并一键申报到税局，快速完成国税申报工作。
（7）税务风险检测：从六大方面 360 度监测企业税负风险。根据行业、地区等横向指标，以及企业历史数据，结合企业整体税负情况，给出健康度评分，进行税负风险检测并给出风险改进措施。
（8）归档处理：支持纳税申报表归档，方便后续财务档案管理。