植物染色体原位杂交是一种重要的分子生物学技术，它可以用来研究植物基因组的结构和功能。该技术利用DNA探针与目标DNA序列的互补性结合，通过荧光或性标记来检测目标DNA序列在染色体上的位置和数量。
植物染色体原位杂交技术的基本原理是将DNA探针标记上荧光或性同位素，然后将其与目标DNA序列进行杂交。在杂交过程中，探针与目标DNA序列互补结合，形成稳定的双链DNA分子。随后，通过荧光或性同位素探测技术，可以检测到目标DNA序列在染色体上的位置和数量。
植物染色体原位杂交技术的应用非常广泛。例如，它可以用来研究植物基因组的结构和功能，包括基因定位、染色体重组、基因表达和基因组演化等方面。此外，原位杂交技术，该技术还可以用来检测植物中的染色体异常，如染色体缺失、重复和易位等。
植物染色体原位杂交技术的优点在于它可以直接观察到染色体上的目标DNA序列，而不需要进行PCR扩增或测序等操作。此外，该技术还可以同时检测多个目标DNA序列，从而提高检测效率和准确性。
和其它实验方法一样，必须同时设对照试验以证明其实验结果特异性。对照试验的设置须根据核酸探针和靶核苷酸的种类和现有的可能条件去选定。ISHH的优点是它的高度特异性，它可测定组织、培养的单个细胞或细胞提取物中的核苷酸含量。应用高敏感度的性标记cRNA探针在理想的ISHH的实验条件下检测mRNA，其敏感度可达到20个mRNA拷贝/每个细胞。由于双链DNA的稳定性，原位杂交，在用ISHH定位DNA时很少发生丢失，降解，荧光原位杂交，其敏感性高到能够显示在染色体铺片上，有时甚至在组织切片上的单个基因拷贝。正因为如此，对ISHH结果的解释应持慎重态度，特别是前人未报告过的新发现。
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