过路费方面：私家车150元/车次
港珠澳大桥全线设置1处主线收费站，双向共有20条收费车道。7座以下私家车、出租车收费标准150元每车次;过境巴士200元每车次;穿梭巴士300元每车次;普通货车60元每车次;货柜车115元每车次。收费方式采用国标ETC和香港快易通等电子不停车收费及人工收费两种方式。大桥收费站现金收费为人民币，非现金结算以人民币计价。未携带人民币的客户，只有在人工收费车道通过银行卡(包括银联、万事达和VISA卡)、支付宝、微信等非现金支付方式进行缴费。
速度方面：最高限速100km/h
大桥主体工程采用内地右侧通行规则，司机抵达或离开香港或澳门口岸后，可根据行车指示牌，按照标志行驶调整行车方式，车辆可完成左右侧交通转换;在非紧急情况下，车辆在大桥主桥及口岸均不允许掉头。
大桥主体工程全线设计通行速度为100km/h，具体通行速度将根据通行情况、气候情况、交通事故处理、交通控制等因素进行调控。就大车而言，有关车辆在大桥主桥行驶时须使用慢线，车速限制为80km/h。
由于内地和港澳车辆超限标准不同，司乘人员须遵守各区域的通行规则，根据各地超限标准行驶。香港货车最高限载标准为44吨，内地货车最高限载标准为49吨(车货总重)，澳门货车最高限载标准为38吨。基于属地原则，车辆须遵守当地政府对车辆的要求，例如港澳车辆行驶经过大桥主桥时，必须符合内地的规限。
可通行车辆：
跨境巴士、穿梭巴士、跨境出租车、货运车辆、跨境私家车。
通关方式包括：
合作自助通道：三道闸门、界线分明的新式自助过关通道;
合作人工通道：出境电子管控、入境人工查验的半自助过关通道;
传统人工通道：台并台、肩并肩无缝连接的人工通道。
收费标准：
7座以下私家车、出租车收费标准150元每车次;过境巴士200元每车次;穿梭巴士300元每车次;普通货车60元每车次;货柜车115元每车次。