申请通用航空企业无人机经营许可证的流程可以总结如下：
1.确定无人机类型和适用范围
根据《办法》规定，最大空机重量为250克以上（含250克）的无人机开展航空喷洒（撒）、航空摄影、空中拍照、表演飞行等作业类和无人机驾驶员培训类的经营活动适用于该《办法》。对于无人机开展载客类和载货类经营性飞行活动，目前暂不适用。因此，你需要确定你的无人机类型以及适用范围。
2.注册企业并完成相关手续
要获得无人机经营许可证，你需要注册一家企业，并确保法定代表人为中国籍公民。你的企业必须至少拥有一架无人驾驶航空器，并以该企业名称在中国民用航空局的“民用无人驾驶航空器实名登记信息系统”中完成实名登记。
3.证明具备培训能力
如果你的企业从事培训类经营活动，你需要具有行业主管部门或经其授权机构认可的培训能力。
4.购买保险
为保证无人机经营活动的安全性，你需要为你的无人机购买无人驾驶航空器地面第三人责任险。
5.准备申办资料
包括申请书、企业章程、企业法人营业执照、法定代表人身份证及其复印件、无人机购销合同或者研制情况、拟从事无人机经营业务的资信证明材料、具备相应技术检验检测资质的中国授权机构的无人机检验检测报告及其认证证书复印件、与经营项目相适应的培训能力证明材料、申请人的联系方式和联系人等。
6.提交申办资料
将准备好的申办资料通过中国民用航空局公布的官方渠道提交申请。
7.等待审批
等待民航局各申办环节的审批，正常申办周期在1至2个月的时间。申办成功后，通用航空企业经营许可证会在官网进行公示。
需要注意的是，各地区的申办政策及流程可能存在差异，因此在实际操作前建议先向当地民航管理局咨询相关要求和条件。同时，需要确保所提交的申办资料真实、准确、完整，并按要求完成各项申请手续。
