互联网药品信息服务资格证主要分为经营性互联网药品服务资质和非经营性互联网药品服务资质两种；经营性指的是通过互联网向上网用户有偿提供药品（含医疗器械）信息的服务活动；非经营性指的是无偿提供药品信息，具体申请那一项，取决于公司网上经营性质。
申请互联网药品信息许可证的办理条件：
1、依法设立的企业事单位或其它组织;
2、具备开展互联网药品信息服务活动的相关人员、设施及相关制度;
3、2名以上熟悉药品、医疗器械管理法律、法规和药品、医疗器械专业知识，或者依法经资格认定的药学、医疗器械技术人员。
4、具备网上查询、生成订单、电子合同等基本交易服务功能;
5、具有保证网上交易的资料和信息的合法性、真实性的完善管理制度、设施、设备与技术措施;6、具有执业药师负责网上实时咨询，并有保存完整咨询内容的设施、设备及相关管理制度。
申请互联网药品信息许可证需要准备以下材料：
1、《从事互联网药品交易服务申请表》
2、拟提供互联网药品交易服务的网站获准从事互联网药品信息服务的许可证复印件;
3、业务发展计划及相关技术方案;
4、保证交易用户与交易药品合法、真实、安全的管理措施;
5、营业执照复印件;
6、保障网络安全和交易安全的管理制度及措施;
7、规定的专业技术人员的身份证明、学历证明复印件及简历;
8、仪器设备汇总表;
9、开展的基本业务流程说明及相关材料;
10、企业法定代表人证明文件和企业各部门组织机构职能表;
11、软件评测机构对有关功能模块以及系统安全性的测评报告
申请互联网药品信息服务资格证办理流程
1、申请人向省局政务受理部门提交申请材料。省局政务受理部门在5个工作日内进行形式审查，符合规定的，发给受理通知书，并将申请材料移交药品化妆品流通监管处;不符合规定的，发给不予受理通知书并一次性书面告知申请人所要补正的全部材料。
2、食品药品监督管理局收到申请材料后，在20个工作日内进行审核、审批，批准的，制作《互联网药品信息服务资格证书》，移交省局政务受理部门;不予批准的，制作《不予行政许可决定书》，移交省局政务受理部门;
3、省局政务受理部门收到材料后，在1个工作日内通知申请人，并发放《互联网药品信息服务资格证书》。