大兴亦庄超市食品经营许可证的办理需要准备以下材料：
食品经营许可证申请书。
与食品经营相适应的主要设备设施布局、操作流程等文件。
食品安全自查、从业人员健康管理、进货查验记录、食品安全事故处置等保证食品安全的规章制度。
法定代表人或负责人身份证复印件。
合法使用有关房屋的凭证、对自有房屋拥有所有权或者使用权的书面凭证。
与食品经营相适应的经营场所的使用证明或者生产经营场所的产权证明。
营业执照复印件。
与食品经营相适应的主要设备设施布局、操作流程等文件。
食品安全自查、从业人员健康管理、进货查验记录、食品安全事故处置等保证食品安全的规章制度。
法律、法规规定的其他材料。
在办理过程中，还需要注意以下事项：
申请人应当自备上述材料，并提交原件及复印件，由窗口工作人员进行核对，核对无误后方可接收材料。
申请人应当如实提交有关材料和反映真实情况，并对其申请材料内容的真实性负责。
如果需要现场审查，申请人应当积极配合相关部门进行现场审查，按照审查要求进行整改。
如果申请被批准，申请人应当按照规定领取食品经营许可证，并在其许可类别范围内从事食品经营活动。
如果申请被驳回，申请人可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。
以上信息仅供参考，具体流程和所需材料可能因实际情况而有所不同，建议咨询相关机构获取具体信息。