在石景山区办理预包装食品流通许可证、食品经营许可证和卫生许可证，需要按照以下步骤进行：
一、办理预包装食品流通许可证：
领取食品流通许可申请书，并贴上法人身份证正反面和代理人身份证正反面。
准备法人身份证复印件一张。
如果是没办理营业执照之前需带着“企业名称预先核准通知书”和其复印件一张。
提供企业场所证明并将其复印件一张一并带着（并带有租房单位的公章）。
提供租赁房屋的营业执照和复印件一份。
提供室内平面图照片并打印到A4纸张上，黑白的即可。
准备企业方位示意图，零售预包装食品流程图，食品流通许可申请书，企业公司食品经营场所设备清单，企业公司食品安全管理制度。
准备以上材料之后去工商局食品流通窗口递交即可，大概需要20个工作日（可加急、不核查地址）。
二、办理食品经营许可证：
在指定的窗口领取申请表格，并填写个人和经营信息。
准备好必要的材料并递交。
缴纳相关费用。
等待审批和核查。
在获得审批结果后，持相关证件领取卫生许可证，并在经营场所显著位置公示或摆放。
三、办理卫生许可证：
领取卫生许可证申请表。
提交申报材料。
审核材料并开展现场审查（必要时进行抽样检测）。
审核合格后发放卫生许可证。
请注意，在办理过程中，可能还需要提供其他材料和进行其他步骤，具体以当地相关部门的要求为准。建议您在办理前仔细了解所需材料和流程，并按照要求准备并提交。如有疑问或需要进一步了解，建议咨询石景山区食品药品监督管理局或相关机构。