企业申请食品经营许可证需要准备以下申请材料：
食品经营许可申请书：企业需在食品经营许可申请书上详细填写申请许可的经营项目、经营场所、仓库地址、主要负责人、经营规模等信息，并加盖公章或签字。
营业执照或者其他主体资格证明文件复印件：企业需提供营业执照或其他主体资格证明文件复印件，以证明其具备经营该类食品的资质。
与食品经营相适应的主要设备设施布局、操作流程等文件：企业需提供与食品经营相适应的主要设备设施布局、操作流程等文件，包括主要设备设施布局图等，以证明其具备符合要求的生产经营条件。
食品安全自查、从业人员健康管理、进货查验记录、食品安全事故处置等保证食品安全的规章制度：企业需提供食品安全自查、从业人员健康管理、进货查验记录、食品安全事故处置等保证食品安全的规章制度，以证明其有能力保证食品安全。
食品安全管理员制度：企业需提供食品安全管理员制度，明确食品安全管理员的职责和工作制度，以证明其有能力保证食品安全。
《授权委托书》及被委托人身份证明复印件：如果企业委托代理人提出许可申请时提交，需要提供《授权委托书》及被委托人身份证明复印件。
其他相关材料：根据当地食品药品监督管理局的要求，企业还需提供其他相关材料，如食品安全培训计划、食品安全管理规章制度等。
需要注意的是，不同地区的食品药品监督管理局对申请材料的具体要求可能有所不同，企业需按照当地要求准备申请材料。同时，企业应当保证所提供的申请材料真实有效，并承担相应的法律责任。