首先，申请人应该确认所需要的CE-MDR认证类型。根据医疗器械类型的不同，CE-MDR认证可以分为不同的类别。申请人应该根据自身医疗器械的特点，选择合适的CE-MDR认证类型。
2.确定CE-MDR认证机构
确定CE-MDR认证机构是申请取得CE-MDR认证的第二个步骤。申请人应该选择CE-MDR认证机构是由其国家的认证机构特别认可的、的、有信誉的第三方认证机构。
3.编写和提交申请文件
申请人需要编写和提交CE-MDR认证申请文件。申请文件包括医疗器械相关的技术文档、安全文件和其他必要文件，以证明医疗器械符合欧盟相关医疗器械安全标准。
4.现场审核
CE-MDR认证机构将进行现场审核以确保医疗器械符合欧盟相关医疗器械安全标准。审核人员将进入申请人的生产现场、研发中心和其他相关部门，并采取物理检查、文件审查、采样检验等手段进行审核。审核结果将被记录并编写审核报告。
5.审核报告和取得CE-MDR认证
审核完成后，CE-MDR认证机构将提交审核报告。审核报告将包括审核结论和建议、不符合要求的事项和改进措施。如果审核报告中没有重大不符合项，申请人将取得CE-MDR认证。
6. CE-MDR认证的使用和更新
取得CE-MDR认证后，申请人可以在欧盟市场销售其医疗器械。CE-MDR认证的有效期限为5年。如果需要更新，申请人应该向CE-MDR认证机构提交更新申请。更新程序将类似于次申请CE-MDR认证。
CE-MDR认证并不是一件简单的事情，需要申请人根据以上流程认真准备和办理。同时，申请人也应该注意CE-MDR认证的有效期限，及时进行更新以确保医疗器械符合欧盟相关医疗器械安全标准。