（1）账面上有未分配利润
公司注销时账面上有未分配利润存在是，需要先确定下是否属于清算后所得，如果是清算后的结余需要缴纳个人所得税。这种情况，一般是按照实收资本中自然人股东占比来计算分红的个税。政策依据是财税2009第60号文“关于企业清算业务企业所得税处理若干问题的通知”。
（2）账面上有存货没有实物
如果存货已经销售，却没有做账，没开发票，销售成本不结转，会导致存货数大于实际库存。发生这种情况会被认定为涉嫌偷税漏税，企业需要马上自查并且补缴相关税款，不然被税务稽查到就麻烦了。因此税务注销前，一定要专业的财务人员进行税务自查。
如果存货是已经被损毁了，需要查名原因，如果是真实合理损耗，那么增值税无需处理，如果非正常损失的话，增值税进项就不能抵扣了。政策依据是财税2009号第57号文第十条的规定“企业因存货盘亏、毁损、报废、被盗等原因不得从增值税销项税额中抵扣的进项税额，可以与存货损失一起在计算应纳税所得额时扣除”