冠状动脉功能测量系统作为三类医疗器械，申请生产许可证需要遵循国家药监部门的要求，通常包括以下步骤：1. 准备阶段：项目规划和文件准备： 确定生产计划、质量控制流程、技术规范和生产设备等。
质量管理体系建立： 确保企业建立符合规定的质量管理体系，包括生产工艺和质量控制措施。
2. 申请递交：提交申请： 将准备好的申请文件递交至国家药监局指定部门或相关机构，包括技术文件、质量管理手册等。
3. 审查和评估：初步审查： 相关部门进行初步审查，验证申请文件的完整性和合规性。
技术评估： 对生产技术和设备进行评估，确保符合规范要求。
4. 现场审核和检查：生产场所审核： 对生产场所进行现场审核，确保符合卫生标准和生产要求。
设备检查： 检查生产设备，确保符合技术要求和质量控制标准。
5. 批复和许可：审批通过： 若申请文件和现场符合要求，国家药监局将批准生产许可证。
颁发证书： 颁发冠状动脉功能测量系统三类医疗器械生产许可证，允许在指定范围内生产。
6. 后续监管和更新：合规监管： 获得生产许可证后，企业需遵守相关的监管要求，包括质量控制、定期报告等。
许可证更新： 定期更新生产许可证，确保持续符合标准和法规要求。
这些步骤可能因地区和国家的不同而有所差异。
在办理过程中，需要严格遵守相关法规和标准，确保申请文件的完整性和合规性。
同时，需详细了解当地的医疗器械生产许可证办理流程和要求。