1、高新技术企业认定申请书。
2、前三个会计年度的研究开发费用结构明细表。
3、近一年高新技术产品(服务)收入明细表，近一年收入明细账和近三年管理费用明细表(要从企业账套中打印);研发费用辅助账。
4、近三年研发项目计划及成果、项目性质、立项资料、相关审批资料、专利证书包括知识产权证书、独占许可协议、生产批文，新产品或新技术证明(查新)材料、产品质量检验报告，省级(含计划单列市)以上科技计划立项证明，以及其他相关证明材料知识产权证书(包括发明专利、实用新型专利、非简单改变产品图案和形状的外观设计(主要是指：运用科学和工程技术的方法，通过研究与开发过程得到的外观设计)、计算机软件著作权登记证书、集成电路布图设计专有权、植物新品种;独占许可协议;生产批文;新产品或新技术证明材料(或省级以上有资质的查新单位出具的查新报告);产品质量检验报告;承担省级以上科技项目证明;环保达标证明;其他相关证明材料。
根据《工作指引》规定：研究开发活动是指，为获得科学与技术(不包括社会科学、艺术或人文学)新知识，创造性运用科学技术新知识，或实质性改进技术、产品(服务)、工艺而持续进行的具有明确目标的活动。不包括企业对产品(服务)的常规性升级或对某项科研成果直接应用等活动(如直接采用新的材料、装置、产品、服务、工艺或知识等)。
承办高新技术企业认定专项审计时，判断企业所申报的研发项目是否为符合《工作指引》规定的研究开发活动，注册会计师主要是根据被审计单位提供的近三个会计年度企业研究开发活动情况表(按单一活动填报)及其佐证资料(包括科研项目立项证明、实施情况、核心技术、创新点及其科研成果)，以及询问企业管理层及相关企业研发人员对企业技术成果及科技成果转化高新产品获取的相关情况，会计师一般采用《工作指引》规定的行业标准判断法、专家判断法、目标或结果判定法，对申报企业立项实施的研发项目目标核心技术，是否属于《国家重点支持的高新技术领域》(以下简称《技术领域》)范围，研发成功后获取的科研成果(新技术或新知识)是否属于创造性运用科学技术新知识或实质性改进技术、产品(服务)、工艺的活动成果，进行职业判断，也会借助技术专家的判断意见。
注册会计师依据上述职业判断结果，对被审计单位申报的研发项目的合规性作出初步审计结论。