细胞是生物体形态结构的zuì基本组成单位，是所有生命运动的基础，其生命活动和新陈代谢状态与生物体的生长发育分化、信息交流、遗传进化以及衰老死亡等密切相关。单细胞代谢组学以单个细胞产生的所有分子质量小于1kD的代谢物为研究对象，通过对这些代谢物进行定性定量鉴定寻找关键的代谢通路以及代谢物，旨在揭示生物体生理病理等生命活动的基本规律。
由于单细胞难以获取、细胞代谢物质种类繁多且浓度和组成都处于动态变化当中，因此，单细胞代谢组学研究技术面临着严峻的考验。常用的单细胞代谢组分析方法主要包括荧光法、超微电极电化学发法、色谱法以及质谱法。基于质谱的分析方法具有高灵敏度、高通量以及高分辨率的有点，且无需进行标记就可以对数百种细胞代谢物进行多重分析，是目前应用于单细胞代谢组学研究中zuì前沿的技术。
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