非靶向蛋白质组学是相对于靶向蛋白质组学而言的，靶向蛋白质组学即靶向定量蛋白质组学，基于高分辨质谱仪对目标蛋白质或多肽进行选择性检测，从而实现对目标蛋白质或多肽的精准定量。非靶向蛋白质组学顾名思义，对研究对象没有强烈的针对性，可对混合体系中的蛋白质或多肽进行jīng确定量。
DDA是质谱分析中的一种数据依赖型采集模式，基于DDA采集模式进行非靶向定量蛋白组质组学研究分为标记和非标记两种策略，非标记（Label Free）蛋白质定量策略利用液质联用技术将蛋白质酶解形成多肽后进行质谱分析，通过计算蛋白肽段的鉴定数目和色谱峰面积进行蛋白质相对定量；标记策略如SILAC、iTRAQ和TMT等，将蛋白质利用不同的同位素标签进行标记，酶解消化为多肽后进行质谱分析，通过质谱数据如离子峰强度等推断不同肽段的含量。
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