1、一般纳税人可以抵扣进项税额，小规模纳税人不得抵扣进项税额。
2、一般纳税人使用的是税率，税率分别是13%、9%、6%以及0。小规模纳税人使用的是征收率，法定征收率3%；特殊征收率5%。
3、小规模纳税人可以转为一般纳税人，一般纳税人不得转为小规模纳税人。
4、一般纳税人能够按照国家统一的会计制度规定设置账簿，根据合法、有效凭证核算，能够准确提供税务资料。小规模纳税人会计核算不健全，不能按规定报送有关税务资料。
5、一般纳税人当期应纳增值税税额=当期销项税额-当期进项税额，小规模纳税人当期应纳增值税额=当期不含税销售额×征收率。