个人独资企业，是一类特殊的企业，它由《个人独资企业法》来规定，投资人承担无限责任，与个体工商户非常相像，但与个体户，它可以有自己的名字、招牌等。
有限公司自然人独资，标准称呼是一人有限公司，它由《公司法》规定，原则上与一般有了限责任公司一样，只承担有限责任，股东与公司相分离。由于它只有一个自然人股东，所以，《公司法》特别要求，它必须每年出审计报告。与一般的有限责任公司区别不大。
这两类公司，如果破产时所欠的钱高于公司自身的资产，无力偿还，个人独资企业的投资人必须承担连带的偿还责任。而有限公司，包括一人有限公司，则把公司赔完就完，投资人没有责任。
所以个人独资企业的投资人，与有限公司的投资人相比，责任与风险更大，所以其权力也就更大，可以直接管理公司。而有限公司必须通过股东会→董事会→经理，来管理公司。投资人也可以更方便地撤回资金。
个人独资企业由于与个人联系紧密，所以，其所得视同个人所得，交个人所得税，不交企业所得税。一人有限公司，交企业所得税。
区别如下：
投资主体不同：公司法所称一人有限责任公司，是指只有一个自然人股东或者一个法人股东的有限责任公司。个人独资企业，是指依照本法在中国境内设立，由一个自然人投资，财产为投资人个人所有，投资人以其个人财产对企业债务承担无限责任的经营实体。
转投资不同：对于一个自然人股东的一人有限责任公司对外进行投资时，不能投资设立新的一人有限责任公司。个人独资企业在转投资方面则完全没有限制，个人独资企业的投资人个人完全可以通过受让股份或购买股票的方式成为其他有限责任公司或股份有限责任公司的股东。
民事责任承担主体不同：在一人有限责任公司中，民事责任的承担主体有二，一为公司，二为股东。个人独资企业的民事责任承担主体则显得较为单一，根据《个人独资企业法》第2条、第18条的规定，“投资人以其个人财产对企业债务承担无限责任‘’。
民事责任承担方式不同，也是最本质的不同。一人有限责任公司对债权人承担有限责任，个人独资企业对债权人则承担无限责任。
个人独资企业的优点有三点：
第一，创立容易。例如，不需要与他人协商并取得一致，只需要很少的注册资本等；
第二，维持个人独资企业的固定成本较低。例如，政府对其监管较少，对其规模也没有什么限制；企业内部协调比较容易。
第三，不需要交纳企业所得税。
个人独资企业的设立条件：
1.投资人为一个自然人，且只能是中国公民
(1)投资人只能是自然人，不包括法人。
(2)投资人只能是中国公民，不包括港、澳、台同胞。
(3)国家公务员、党政机关领导干部、法官、检察官、警官、商业银行工作人员等，不得投资设立个人独资企业。
2.有合法的企业名称：个人独资企业的名称中不能出现“有限”、“有限责任”或者“公司”字样。
3.有固定的生产经营场所和必要的生产经营条件
4.有必要的从业人员
5.有投资人申报的出资