99式改进型与原始设计外型上的差异就是炮塔正面的附加装甲和取消了正面V字形档弹板;99式的主要量产工作都集中在第二次的改良构型,原始设计只是一种过渡型号。99改进型炮塔正面的箭簇型装甲基本结构有两层,本体是一个中空的箱子,并在正面与侧面前部的外部再用增加一层装甲(以螺栓固定);因此,装甲套件本身至少有外部装甲板与内部结构本体这两部分的装甲,而本体的中空结构也有助于消散HEAT穿甲喷流的威力。除了炮塔正面装甲之外,99式改进型车的体正面与炮塔两侧也加装不少方形装甲块(应为反应装甲);炮塔两侧中部到整个炮塔尾部设置一个大型的整体储物架,中间可以加挂水箱等随车物品,而炮塔两侧的储物架外侧则设有装甲板;这个储物架能提前引爆敌方HEAT,在不增加太多重量的情况下,加强了炮塔两侧与后部的防护能力。