健康证书的办理是企业在货物备齐后申请检验，检验检疫部门会按标准要求从货物中抽取代表性样品检测，结果符合标准要求则签发健康证书。一般是在出货前办理好的。
健康证书具体的办理流程为：
1、货物符合出口的要求，准备好相关材料，产品检测报告、合同、商业发票、装箱单、营业执照、生产许可证等必要材料。
2、健康证申请表格准备，按要求填写申请的表格
3、提供健康证申请表及相关材料，中国检验集团CCIC对材料审核，符合出口货物的标准，签发健康证Health Certificate。
健康证书在货物清关中扮演着非常重要的角色。它是海关清关的重要凭证之一，是商品进入目的地国家的必备文件之一。有食品接触相关的产品的货物出口的企业需要提前了解相关信息。