非靶向蛋白质组学又称发现蛋白质组学或非靶向蛋白质组学，是相对于靶向蛋白质组学来说的，二者是蛋白质组学按照研究目的或研究对象不同进行分类的产物。非靶向蛋白质组学，就是对来自机体、器官、组织或细胞的蛋白或多肽样品中的全部组分进行系统、全面和无偏向性的鉴定分析，研究其种类和数量以及随机体生命活动变化的规律，非靶向蛋白质组学可用于发现不同样本中的差异蛋白，为寻找新的蛋白/多肽生物标志物提供了方法和途径。
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