宏蛋白质组是指特定条件下环境中微生物表达的全部蛋白质，如肠道微生物、土壤微生物、活性淤泥中的微生物、水体微生物和食品微生物等表达的所有蛋白质。宏蛋白质组学（metaproteomics）就是以宏蛋白质组为研究对象，对其种类、活性和功能等进行分析鉴定，通过进行蛋白质层面的研究也有助于微生物群落结构的研究。
宏蛋白质组学作为蛋白质组学
的一个子领域，已迅速成为在功能水平上对微生物组系统进行全面表征的关键工具。此外，它也越来越多的应用于研究人类消化和代谢疾病，并提供丰富的信息数据来识别与健康或疾病相关的人类肠道微生物群的生态失调，以阐明宿主-微生物群相互作用的分子事件。虽然目前仍然存在重大的技术挑战，但这项新兴技术已被证明可以提供解释人类肠道微生物组功能变化的重要信息，是宏基因组学和宏转录组学的补充。
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相关服务：蛋白质组学
蛋白鉴定
蛋白质结构鉴定
翻译后修饰蛋白组分析
定量蛋白组分析
序列分析
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