棚室土壤改良的时机应选在春种前和秋净地后进行，两茬栽培的应在换茬间净地时的空当进行。通常在地面施肥料后，都需要翻耙土壤，以充分发挥肥效，减少肥料的挥发损失。
(一)土壤酸化的改良措施
1.正确选择肥料。改变盲目使用肥料现象，按需供给，既保证产量，又利于品质，还可减少成本，更重要的是保证了蔬菜使用安全和持续性耕作。
2.推广使用腐熟生物有机肥。生物有机肥含有多种有益微生物、氨基酸、多肽、酶、抗生素，不仅可增进士壤肥力，改良土壤结构，还能提高土壤微生物活性，增强蔬菜的抗病能力，具有化学肥料的优越。在蔬菜种植中，应广泛推广使用生物有机肥料，并配以使用适量化学肥料。如使用充分腐熟的鸡粪，还可以选择秸秆生物反应堆改良土壤。
3.覆土和换土。如果蔬菜大棚土壤退化严重，可对土壤实行深翻，将退化土壤深埋;或者将表层土壤挖走更换清洁土壤。特别是蔬菜大棚土地面积相对较小时，覆土或换土成本相对降低，此种方法具有较强的可行性。
4.施用改良剂。每667平方米用EM原露200毫升，加水100千克喷施表土，或浇人植株根际周围，每年处理2次以上，连用2年，可逐渐平衡士壤酸性，提高土壤肥力。
(二)土壤盐渍化的改良措施
1.调整温室大棚的各种类肥料施用量。增加有机肥比例，降低化肥等无机元素的施用比例，施肥量应根据植株具体生长需要来设置，不能过量施肥，而且可以采取多次少量的施肥办法，一方面增加了化肥的利用率，另一方面也防止了盐渍化现象的发生。
2.如果土壤盐渍化现象已发生，就施加土壤改良肥，可适量反应掉一些无机元素， 防止土壤盐渍化现象的恶化和蔓延。
3.在选择蔬菜品种时选择耐盐性的蔬菜，有些产品对盐分含量不敏感，不会影响产量。