厨房垃圾处理器方便归方便，但也有人担心地指出，经过粉碎后的厨余垃圾会引起下水道堵塞。事实证明，厨房垃圾处理器这种担心并非多余。
上海市绿化和市容管理局局长邓建平日前表示，受限于上海排水管道的条件和污水处理的能力，如果将厨余垃圾粉碎排入下水道，很有可能造成污染河道、堵塞管道等影响。上海这样的大城市且如此，其他中小城市的下水道容纳能力，厨房垃圾处理器恐怕也不会太理想。
除了加重管道负担，厨房垃圾处理器更为担心的是，厨余垃圾不经分类挑拣，直接粉碎，似乎背离了垃圾分类的初衷。一定程度上相当于把压力转移给了排水和污水处理部门，甚至可能间接造成污染。
“厨余垃圾粉碎与垃圾分类的理念是矛盾的，更不利于资源回收。”北京天龙天天洁再生资源回收利用有限公司总经理刘权表示，厨房垃圾处理器垃圾得到回收、尽可能再利用是最环保的方式，垃圾被打碎排进下水道，最终成为沉淀物，也就无从谈起再利用。