皇岗口岸建成至今已30年，虽经改造但通关环境与深圳城市形象不符，通关效率和查验模式也难以满足粤港澳大湾区背景下深港各资源要素便捷流通的需求。
5月14日，深圳市口岸办召开了深圳口岸通关改革创新研讨会新闻通气会，会上探索了口岸运行机制、体制、模式等方面的创新路径，拓展大湾区建设背景下的深圳口岸工作新思路。
·目前深圳市已计划对皇岗口岸进行重建，并由原深圳市规划国土委牵头开展了深港科技合作创新区空间规划和皇岗口岸重建专项规划研究，初步形成了口岸原址重建和异地重建两类方案。
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皇岗口岸有望采取“合作查验、一次放行”的查验模式，方便旅客通关，未来将保留深圳湾口岸货检功能，取消皇岗口岸、沙头角口岸、文锦渡口岸的货检功能。
新口岸方面，莲塘口岸于2013年11月正式动工建设，目前总体工程（除“一站式”项目建设外）基本完成，场地配套完成总工程量95％，已进入查验单位设备安装阶段，力争在2019年第三季度具备开通运行条件。
目前，针对如上的新思路新规划，深圳市口岸办已经多次征求驻深查验单位的意见，并与香港特区政府进行初步沟通，同时，也已就有关事项向国家口岸办去文，提请支持协调。
莲塘口岸方面消息：
莲塘口岸目前总体工程（除“一站式”项目建设外）基本完成，场地配套完成总工程量95％，已进入查验单位设备安装阶段，有望今年第三季度具备开通运行条件。
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莲塘口岸即将开放，粤港两地车牌的办理条件如下：
（一）粤港两地车牌申请投资类指标
(1) 到广东省投资的国外、港澳台商户，在广东省境内上一年度纳税额满足下列条件可申请粤港车牌：
1．上一年度纳税数额须达到15万元以上; 申办第1辆商务车指标。
2．上一年度的纳税数额须达到50万元以上; 申办第2辆商务车指标。
3．上一年度的纳税数额须达到100万元以上;申办第3辆商务车指标。
4．从申办第4辆商务车指标起，上一年度的纳税数额每增加100万元即可增办1辆商务车指标，多不超过15辆。
(2) 广东省企业上一年度纳税数额达到100万元以上的，可以申办1辆内地入出香港商务车指标。
（二）粤港两地车牌申请人才类指标
在港澳工作的中国科学院院士、中国工程院院士和港澳的大学现任校长，以及持有广东省人才优粤卡A卡的港澳台、外籍人士，可以申办1辆港澳入出内地商务车指标。
（三）粤港两地车牌申请捐赠类指标
改革开放以来海外华人华侨、港澳台同胞捐赠累计金额达300万元以上，或者社会团体捐赠累计金额达1000万元以上的，可以申办1辆港澳入出内地商务车指标。