高企认定工作指引指出企业创新能力评价体系中研究开发组织管理水平评分占比20%，阜阳高新技术企业认定，这就要求企业在日常研发过程中对研发流程的梳理、管理制度的执行、奖励政策的体现都要明确规范。如果没有申请过高新技术企业的或者三年前曾经申请过高新技术企业的企业均可以申报。企业如在获得高新技术企业资格后，在有效期限内发生企业名称变更的，需要在高新技术企业管理工作网上进行更名并到相关部门递交相应的更名资料。
高企申报前，国家高新技术企业认定申请，应该全方面梳理企业的知识产权状况，如果知识产权情况不达标，则应该及时的利用现有的符合申请条件的知识产权，查缺补漏，高新技术企业认定申报，提前布局。高企对企业的要求大约如下：不低于10%的研发人员，近三年研发费用不低于4% (营业额达到两亿以上的企业)或5% (营业额两亿以下的企业)， 高新技术企业认定代理，近三年的年度审计报告，企业创新能力评价分在70分以上。
企业要注重高新技术产品（服务）合同管理及票开具的规范性，关注产学研合作 协议的有效性。做好高新备查有关资料整理存档，随时应对有关部门的检查工作。企业在获得高新技术企业资格后，在其资格有效期内应每年5月底前通过“高新技术企业认定管理工作网”，报送上一年度知识产权、科技人员、研发费用、经营收入等年度发展情况报表。
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