微阵列芯片应用流程
1）制备靶点
从生物标本中提取核苷酸并进行标记；
（2）杂交
让靶点与芯片上的cDNA或寡核苷酸序列进行孵育；
（3）获取数据
扫描与探针杂交的靶点表现出来的信号强度
（4）数据分析
从大量数据中得出具有生物学意义的结论
微阵列芯片技术通过测定能够与探针杂交的mRNA的数量，反映表达此mRNA的基因的转录情况，芯片的构建首先要根据研究的需要选择基因及相应的探针，蛋白固化剂，其次是从标本中提取mRNA，并制备出靶点，然后将靶点加入芯片，进行孵育杂交、冲洗掉没有杂交的样品以及扫描等操作，蛋白固化目的，得到原始数据，再将这些数据进行标准化和统计分析后得到结论，构造适当的微阵列芯片是开展后续研究的基础。
这种生物芯片的基因译码速度比传统的Sanger和 Maxax Gilbert法快1000倍，是一种有希望的快速测序方法。1996 年底，美国旧金山AFFYM ATRIX公司 Steven Fodor等充分结合并灵活运用了照相平板印刷、计算机、半导体、激光共聚焦扫描、寡糖苷酸DNA合成、荧光标记探针杂交及分子生物学的其他技术，创造了世界上块 DNA芯片或DNA列阵(DNA chip or DNA arrays)，即基因芯片。
实际操作时需要注意的是，虽然共价偶联的方法优于物理吸附，但基于氨基和羧基的抗体固定方法仍具有一定程度的随机性，有时在Fab区（用于结合抗原）存在易于修饰的氨基/羧基，江西蛋白固化，在与固体表面偶联后会造成抗体的失活。在抗体领域，抗体与的偶联同样存在上面所说的问题（由于抗体表面可能存在很多可修饰的氨基酸，不能确定连在哪个部位
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