目前，由于灵敏度所限，多数方法需要在标记和分析前对样品进行适当程序的扩增，不过也有不少人试图绕过这一问题，如 Mosaic Technologies 公司引入的固相 PCR 方法，引物特异性强，无交叉污染并且省去了液相处理的烦琐； Lynx Therapeutics 公司引入的大规模并行固相法 (Massively parallel solid-phase cloning) ，可在一个样品中同时对数以万计的 DNA 片段进行，氨基化处理方法，且无需单独处理和分离每个。
现阶段，因为敏感度限制，大部分方式必须在标识与分析时对样品开展适度的程序增加，但是也有很多人尝试绕开这一难题，如MosaicTechnologies企业引入的固相PCR方式，引物设计非特异强，无而且免去了液相处理繁琐；LynxTherapeutics企业引入大规模的并行处理固相法(Massivelyparallelsolid-phasecloning)，可在一个样品中并且对不计其数的DNA精彩片段开展，且不用独立和处理分离出来每一个。 
cDNA基因百度文库由PCR物质构成，为发夹结构构造，长短一般在百余至千余碱基对，因此芯片的混种杂交标准对每一个基因无法保证是好的，假阳性率比较高，因而，判断cDNA微阵列的后的结果时，氨基化处理，必须对挑选出的基因开展测序。在应用cDNA微阵列开展研究时，氨基化处理厂家，一般需要提供一个对比样版，把与必须研究的样本给与不同类型的标识，将二者灯亮混匀一同引入芯片开展孵育。扫描仪后所得到的原始记录是每个表格中中网络信号的比例。 
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