蛋白质组学靶向和非靶向是根据研究的蛋白质是否是特定的来区分的，靶向蛋白质组学是针对一个或多个特定的目标蛋白质进行研究，非靶向蛋白质组学则是对尽可能多的或体系中包含的全部蛋白质进行研究。往往通过非靶向蛋白质组学研究找到感兴趣蛋白或关键蛋白后可利用靶向蛋白质组学技术进行进一步研究和验证。
常用的靶向定量蛋白质组学质谱技术是基于SRM（选择反应监测）和PRM（平行反应监测）扫描模式进行的，其特别之处在于一级质谱后选择特定的母离子进行二级质谱碎裂，并对母离子产生的子离子对进行检测分析。非靶向定量蛋白质组学技术主要是基于DDA（数据依赖型采集模式）和DIA（数据非依赖型采集模式）进行的，如Label Free、TMT、SILAC、iTRAQ和SWATH定量技术。
百泰派克生物科技采用Thermo公司zuì新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪结合Nano-LC纳升色谱，提供高效快速的靶向定量蛋白质组学和非靶向蛋白质定量组学服务技术包裹，可对目标蛋白或多种蛋白进行jīng确的定量鉴定，还可根据需求提供定制化检测方案，满足多种实验需求，欢迎免费咨询。
百泰派克生物科技-生物药物表征，生物质谱多组学优质服务商
北京百泰派克生物科技有限公司（Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 简称BTP）从事以生物质谱为依托的生物药物表征，大分子物质（包括蛋白质、多肽、代谢物）质谱分析以及小分子物质检测服务。
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