医疗器械独立软件和软件组件在以下几个方面存在区别：
功能完整性：医疗器械独立软件具有完整的功能，可以独立完成特定的医疗任务或辅助医疗过程；而软件组件只是构成医疗器械独立软件的各种模块或子程序，不具备完整的功能。
开发难度和成本：医疗器械独立软件的开发难度较大，需要专业的开发团队来完成；而软件组件的开发难度较小，可以利用现有的开源库或第三方SDK来实现。因此，医疗器械独立软件的开发成本也较高，而软件组件的开发成本较低。
运行平台：独立软件(SaMD)是指一种能够独立运行于通用计算平台的软件，它具有一个或多个医疗目的/用途，无需依赖医疗器械硬件即可实现预期功能。该通用计算平台需满足信息技术设备安全要求(包括电磁兼容性)，符合GB 4943.1、GB/T 9254等标准。而软件组件(SiMD)是指具有一个或多个医疗目的/用途的软件，用于控制或驱动医疗器械硬件，或运行于医用计算平台。医用计算平台符合医用电气设备(GB 9706系列)、实验室用电气设备(GB 4793系列)或有源植入式医疗器械(GB 16174系列)等安全要求(含电磁兼容)。医用计算平台可以与通用计算平台联合使用，构成一个系统，整体视为医用计算平台。
至于医疗器械经营许可证办理的全部流程，一般包括以下步骤：
企业提出申请：企业向所在地省、自治区、直辖市药品监督管理部门提出申请。
现场核查：省、自治区、直辖市药品监督管理部门组织技术审评机构进行现场核查。
审核批准：省、自治区、直辖市药品监督管理部门对申请资料进行审核，符合要求的批准发给医疗器械经营许可证。