印度尼西亚是世界上清关最困难的国家之一。该国的海关分为红灯海关和绿灯海关。红色海关更注重保护本地生产同样商品的企业。严格的海关措施。
1、清关所需文件
1）商业发票；
2）原产地证明书；
3）海运提单；
4）植物卫生检验证，用于活体植物和植物材料；
5）兽医证书，用于动物(单蹄动物、反刍动物和猪)；
6）检验证书，用于输血仪器；
7）卫生证书，用于食品、饮料；
8）涉外公证书，用于代合理合同。
2、其他清关要求
1）寄往印尼的成衣服饰类产品，其价值若达到或者超过250美金，随货需要提供原产地提供的相关鉴定证书。所有进口当地的成衣货物，如超过10件或货值超过USD1500元，收件人须持有以下文件：
①进口许可证；②合格检验证书；③向贸易部门申请的书面报告。
2）印度尼西亚针对化妆品做出严格的进口要求，寄件人和收件人可登录网址【 pom.go.id/index.php/home/en 】查询具体要求，所有化妆品进口货值超过USD1500，或者电子产品数量超过2件，收件人须持有检验合格证书。
3）所有单票超过100KG及以上的货物，收件人/收件公司须提供以下法定文件：
①Original POA海关授权委托书正本，货物到达后提供；
②B2B货物：随货提供Tax ID No：15位数税号，运单及发票均需注明，公司/个人都是有税号的；
③B2C货物：自2022年7月1日起，印度尼西亚海关不再接受驾驶执照号码作为通关的身份号码。
根据印尼海关的规定，通关身份号码的要求总结如下：
a.企业：进出口货物必须提供印尼税务ID号,在印度尼西亚称为NPWP-Nomor Pokok Wajib Pajak，不允许使用其他ID号。
b.个人：进口和出口货物都需要提供印尼税务ID号,在印度尼西亚称为NPWP-Nomor Pokok Wajib Pajak，如果个人没有申请纳税身份证号码，他们也可以提供以下身份证号码作为替代，印尼国民的印尼身份证号码/NIK-Nomor Induk Kependudukan，外国人护照号码。
④import ID No (API) 进口许可证号，请随货提供；
⑤Customs ID No (NIK) 海关识别号码，请随货提供。
4）收件人为个人，酒店宾馆，银行，展览名义进口参展商，或者不具备或拥有相关进口许可权等有效进口身份证明的任何收件人，进口单票货物重量不能等于或者超过100公斤，超过即不允许进口。
5）皮革类货物，随货均需要提供正本原产地证明以及卫生证明。
6）自2020年1月30日起，印度尼西亚进口关税起征点由75美金调整至3美金.
7）进口织物和纺织品，为了避免在清关方面出现延误，原产地要求遵守下列注释中突出说明的布料的进口规定:寄件人必须以码或米为单位申报纺织材料的计量单位(UOM)，(布样布除外，其UOM应为件数)，请确保发货人在发票上包含上述描述。如果不能提供详细的描述，可能会在2-5天内由于货物检验/海关需要更多的文件。
8）寄给收件人为个人的包裹，若包裹内含电子或通讯产品（手机cell phones，智能手机，掌上电脑handheld computer，I-PAD，I-Phone，PDA及平板电脑tablet computer)）等，不论相关产品数量多少，需要收件人提供从贸易部门（Ministry of Trade）获得的进口许可证方可安排进口。随货运单及发票上必须清楚注明IMEI号码(International Mobile Equipment Identity)。否则，可能会导致海关延迟，直到提供信息。
3、特别注意事项
抵达印度尼西亚的货物必须在 30 天内纳税。货物在雅加达港超过期限后，将被送往国家港口公司所属监管机构的简易仓库，货物可存放1-3个月。逾期未接运的，将由港务局拍卖，拍卖所得将用于支付仓储费。