企业自己申请ISO 9001认证可能会遇到以下几方面的问题：
一、对标准理解方面
• 标准解读不准确
• ISO 9001标准包含了质量管理体系的多项要求，如以顾客为关注焦点、领导作用、过程方法等原则以及具体的条款要求。企业如果没有经过专业的培训，可能会对这些标准的含义理解产生偏差。例如，对于“过程方法”的理解可能仅停留在表面，无法深入理解如何识别、管理和改进过程以实现预期的结果。
• 难以把握关键要求
• 在标准中，有些要求对于质量管理体系的有效性至关重要。比如“基于风险的思维”，企业可能不知道如何系统地识别、评估和应对与质量相关的风险。另外，对于质量目标的设定，可能无法确保其既符合企业的实际情况又具有挑战性且可测量，导致质量目标难以真正起到引领质量管理体系运行的作用。
二、文件编制方面
• 文件体系不完整
• 质量管理体系需要一套完整的文件体系来支撑，包括质量手册、程序文件、作业指导书和记录等。企业自行申请时，可能会遗漏某些关键的文件或者文件之间的关联性不强。例如，只注重程序文件的编写而忽视了作业指导书的细化，导致操作人员在实际工作中缺乏具体的操作依据。
• 文件内容不符合实际
• 编写的文件如果没有充分结合企业的产品特点、生产流程和管理模式，就会出现文件规定与实际操作脱节的情况。比如，在文件中规定了严格的检验流程，但实际生产中由于设备、人员等因素限制无法按照文件执行，使得文件流于形式。
三、实施过程方面
• 部门协调困难
• 质量管理体系的建立和运行涉及企业多个部门，如生产、采购、销售、质量等。在没有外部协调的情况下，各部门之间可能存在职责不清、沟通不畅的问题。例如，在质量改进项目中，可能出现质量部门提出的改进措施得不到生产部门的积极配合，导致改进工作难以推进。
• 资源配置不合理
• 实施质量管理体系需要投入相应的资源，包括人力、物力和财力。企业可能难以准确评估所需的资源数量和种类。比如，在人员培训方面，不知道应该安排哪些人员参加哪些培训课程，或者在设备更新方面，不确定哪些设备需要升级以满足质量要求，从而影响质量管理体系的有效运行。
四、审核准备方面
• 审核流程不熟悉
• 企业对于认证审核的流程，包括审核的阶段（如文件审核、现场审核等）、审核的方式（如面谈、查阅文件和记录、现场观察等）以及审核员的关注点等可能不太清楚。这可能导致企业在准备审核时没有针对性，无法充分展示质量管理体系的运行效果。
• 不符合项整改困难
• 即使企业经过努力建立了质量管理体系，但在审核过程中仍可能发现不符合项。对于这些不符合项，企业可能由于缺乏经验而难以制定有效的整改措施，或者整改措施不能满足审核员的要求，从而影响认证的最终通过。